Tin tức về cái chết của María de las Mercedes đã dẫn đến sự ra đời của nhiều bài hát dân gian về sự qua đời của Vương hậu,[8] đáng chú ý nhất là bài copla nổi tiếng, với nhiều biến thể ở Tây Ban Nha và Mỹ, đặc biệt phổ biến đối với trẻ em khi đi kèm với trò chơi nhảy dây.[9] Theo Benito Pérez Galdós, ông đã nghe về bài hát đó vài ngày sau sự việc: “ ¿Dónde vas Alfonso XII? ¿Dónde vas triste de ti? Voy en busca de Mercedes que ayer tarde no la vi…” ("Ngài đang đi đâu hỡi, Alfonso XII? Ngài đang đi đâu hỡi người đàn ông đau buồn? — Ta đang đi tìm nàng Mercedes, người mà ta không gặp được vào chiều qua..." ).[9] Một bộ phim về mối tình lãng mạn giữa María de las Mercedes và Alfonso XII của Tây Ban Nha có tên là Where Are You Going, Alfonso XII?, được phát hành vào năm 1958. [10]

Vương hậu María de las Mercedes đã đồng khởi xướng việc xây dựng Nhà thờ chính tòa Almudena ở Madrid, đối diện với cung điện vương thất và được bắt đầu xây dựng vào năm 1883. Vào tháng 5 năm 2004 Felipe VI của Tây Ban Nha, bấy giờ là Thân vương xứ Asturias, đã kết hôn với Letizia Ortiz tại đây. Bên cạnh đó, ngày 8 tháng 11 năm 2000, hài cốt của Vương hậu María de las Mercedes được an táng lại tại đây, theo nguyện vọng của chồng Alfonso XII của María.

Một thị trấn ở tỉnh Isabela, phía bắc Philippines được đặt tên là Reina Mercedes để vinh danh Vương hậu Mercedes vào năm 1886 khi chính quyền thuộc địa Tây Ban Nha chính thức tách thị trấn này khỏi Cauayan.

Khi bộ trưởng của Nhà vua Cánovas del Castillo đề nghị Alfonso XII lấy một người vợ mới, nhà vua đã đồng ý và chọn em gái của Mercedes là María Cristina. Tuy nhiên, María Cristina cũng mắc bệnh lao và qua đời. Cuối năm 1879, Alfonso XII tái hôn với Nữ đại vương công Maria Christina của Austria-Teschen; và đặt tên cho người con cả của họ là María de las Mercedes để vinh danh cố Vương hậu María de las Mercedes của Orléans.